Alpine ha preso il controllo assoluto dell'apertura due ore alle 6 ore di Fuji, bloccando la parte anteriore del campo con un pugno mozzafiato 1-2. La pole-sitting #36 A424 Hypercar ha dettato il ritmo direttamente dalla caduta della bandiera, con Jules Gounon che guida la carica prima di consegnare la macchina al compagno di squadra Victor Martins durante la prima fermata prevista. Il rookie francese ha capitalizzato in un periodo di Safety Car di seconda ora per estendere un piccolo vantaggio alla testa della confezione, mantenendo l'autista sorella-auto Ferdinand Habsburg nella #35 Alpine a bada durante la seconda ora.
È stato un inizio caotico dietro i leader, punteggiato da una scommessa off-strategy da Nyck de Vries nel #7 Toyota TR010 Hypercar. Accelerato da una lenta puntura a sinistra, l'olandese tentò una mossa su Ferdinando Asburgo che fallì completamente, con conseguente contatto e un giro che gli costò istantaneamente circa 15 secondi. Fortunatamente per i leader del campionato, una Safety Car di seconda ora ha annullato quel pesante svantaggio e ha trascinato la #7 Toyota nel mix leader. Nel frattempo, Aston Martin ha stabilito un formidabile terzo posto con il #007 Valkyrie Hypercar gestito da Harry Tincknell. La sorella #009 Aston Martin ha anche mostrato un ritmo serio mentre Marco Sørensen ha dato la caccia al posteriore del #007, anche se Daniel Juncadella ha agito come un robusto blocco stradale in quarta con la #19 Genesis Magma Racing GMR-001 Hypercar.
Più in basso l'ordine, Earl Bamber ha lottato il #38 Cadillac Hertz Team JOTA V-Series. R in sesta dal segno di due ore, recuperando bene dal primo contatto di gara con il #79 Iron Lynx Mercedes-AMG LMGT3. Home preferiti TOYOTA RACING si siede settimo e ottavo, con Sébastien Buemi in testa al recupero de Vries come il produttore giapponese combatte per rivendicare una notevole decima vittoria casalinga a Fuji Speedway dal 2012. La seconda Cadillac V-Series.R di Will Stevens detiene nono, anche se questa posizione rimane sotto una nuvola a causa di un'indagine per un'infrazione pit-stop. Il team Peugeot TotalEnergies ha visto Paul di Resta correre all'interno della top ten dopo aver sopravvissuto ad una truffa di prima ora dove si è bloccato e ha dovuto bypassare la chicane. Purtroppo, proprio mentre la terza ora si avvicinava, di Resta fu costretto a staccare la pista con un sospetto problema di cambio, tornando ai box sotto il risultato di Full Course Yellow. La Ferrari subì un livido che si apriva due ore, lasciando la #50 che correva decima sulla scia della questione di Resta, mentre James Calado sopravvisse ad un giro selvaggio sull'erba a Turn Five nel #51 499P dopo essere stato costretto largo dalla #33 TF Sport Corvette.
Nella categoria LMGT3, Finn Gehrsitz ha messo su una clinica assoluta presto nella #58 Garage 59 McLaren. Sfruttando al meglio l'azione caotica della prima ghianda e le squadre rivali in campo piloti concategoria del bronzo, il giovane tedesco ha scavato una splendida pista di 54 secondi prima di consegnare ad Alexander West. Quel vantaggio scomparve quando una Safety Car di media corsa schierata per recuperare il danneggiato #23 Heart of Racing Team Aston Martin Vantage - che sconfisse con il #94 Peugeot 9X8, guadagnando la Peugeot una pena di cinque secondi - ha portato l'intero campo insieme. Quella neutralizzazione ha scatenato una folle lotta tra la #58 McLaren e la #91 Manthey DK Engineering Porsche di James Cottingham, che ha guidato come un uomo posseduto dalla parte posteriore della griglia di partenza per guidare brevemente la categoria prima di pitting per consegnare a Timur Boguslavskiy.
Quel frenetico ciclo di pit ha consegnato la LMGT3 porta alla #88 Proton Competition Ford Mustang pilotata da Eric Powell. Salih Yoluç detiene il secondo posto per Racing Team Turkey di TF Corvette in seguito a una serie di bellissime mosse di sorpasso, mentre il Team WRT si è spostato fino alla coda della categoria per garantire la terza con la #69 BMW M4 guidata da Anthony McIntosh. La #58 McLaren si trova al quarto posto dopo aver fatto una prima seconda tappa, seguita dal #87 Akkodis ASP Team Lexus e dal leader dei punti #33 TF Sport Corvette arrotondando le prime sei.
Tutta questa follia ripercorre un'enorme melee di prim'ordine che ha subito rivendicato due vittime. Il #88 Proton Competition Ford Mustang di Stefano Gattuso e il #61 Iron Lynx Mercedes-AMG di Martin Berry sono stati entrambi costretti in pensione con gravi danni agli incidenti. Tom Van Rompuy ha preso la colpa per il massacro nel #78 Akkodis ASP Team Lexus, schiaffeggiato con una penalità di cinque secondi per aver innescato il pile-up dopo essersi inciampato in Turn One. Diversi altri hanno sofferto nel caos, tra cui la #87 Lexus e la #92 The Bend Manthey Porsche, che è stata costretta a scavare per le riparazioni e precipitato sul retro dell'ordine. Dopo il riavvio, François Hériau sopravvisse a un lurido giro durante una battaglia per il quinto, riuscendo a trascinare la #21 VISTA AF Corse Ferrari sul binario sul retro del restante campo LMGT3 da 16 car, mentre Johannes Zelger di Iron Lynx coppe una penalità di cinque secondi per il clashing con Cadillac di Earl Bamber.
